得了虎符后，王珪让太子的一个亲信武将去调兵，自己和魏征则没有立即离去，而是留下和太子妃商议如果败亡怎么办？！未虑胜，先虑败。
太子妃就说了句：“赵氏孤儿。”
王珪、魏征相视而哭：“太子要是早听吾等先诛杀秦王何至今日！”
“叔玠！你说卑微的活着和从容赴死哪个容易？”魏征问王珪。
“死！”
“君才高征十倍....”魏征露出坚毅的眼神。
“不可！谁都不能死！现在还没到最后时刻！好好活着！”太子妃喝道。
“主母！这...”魏征愣了愣。
“召唐仲玄！”太子妃示意魏征。
片刻，东宫暗卫首领唐仲玄到了。
“唐君！太子待你如何？”太子妃问道。
唐仲玄行军礼单膝跪道：“知遇之恩、护佑之恩如吾之贵人！吾唐家得以在巴蜀生存，洗脱刺客谍间恶名，全靠太子周全照应。”
“今太子生死未知，未虑胜，先虑败。有一事只能托付于卿！”
“仲玄敢不为主公尽忠！三生三世亦要报之！”
“来人！”太子妃示意婢女进入内房，须臾，将一婴儿抱出，递于唐仲玄。
“唐君！这可能是太子最后的血脉。就托付于君了！你速速从密道离去。城外有杨元度已经派人接应了。”太子妃将婴儿递于唐仲玄。
“杨汪么？”魏征道。
就在太子妃有条不紊的安排的时候，玄武门那边---太子李建成的部下、翊卫车骑将军冯立得知太子身死，叹息道：“岂有生受其恩，而死逃其难乎！诸君随我诛杀叛逆李贼！”于是，他与副护军薛万彻、屈直府左车骑谢叔方率领精锐兵马两千人，开始冲击玄武门，准备为太子和齐王报仇。但是秦王部将张公谨膂力过人，他独自关闭了大门，挡住冯立等人，冯立等人无法进入。
这时候云麾将军敬君弘掌管着宿卫军，驻扎在玄武门北。眼见张公瑾支持不住了，他挺身而起，准备出战帮助秦王，不过他的副将阻止他说：“事未可知，且徐观变，等到兵力汇集起来，结成阵列再出战，也为时不晚。”敬君弘不听从，便与中郎将吕世衡大声呼喊着向冯立军阵冲去，结果全部战死。把守玄武门的士兵与薛万彻等人奋力交战，持续了很长时间，薛万彻擂鼓呐喊，准备进攻秦王府，将士们大为恐惧。此时，尉迟恭提着建成和元吉的首级给薛万彻等人看，东宫和齐王府的人马顿失战心，迅速溃散，薛万彻与骑兵数十人则逃入终南山中。冯立杀死敬君弘后，对部下说：“这也可以略微报答太子殿下了。”于是，他丢掉兵器，落荒而逃。
政变发生时皇帝李渊正在宫内的海池上划船，李世民让尉迟恭入宫担任警卫。尉迟恭身披铠甲，手握长予，一身戎装，满脸血污，径直来到李渊所在的船上。他大惊，问道：“今日作乱的人是谁？爱卿到此做什么？”
尉迟恭答：“太子和齐王作乱，秦王正在平定。”
李渊又问：“你来干什么？”
“保卫陛下。”
李渊松了一口气，只要不是来杀自己的，当然一切都好商量。接着他便问在一旁的宰相裴寂：“事到如今，这...？”
裴寂没有说话。
不过另外两位却异口同声：“秦王功盖宇宙天下归心，若能立为太子付以国务，则陛下如释重负，苍生欢欣鼓舞。”
李渊闻言道：“这正是我早想做的。”
这怕是言不由衷。天策军尉迟恭戎装持械擅自闯宫，已经触犯刑律。因此同样可以肯定，禁卫军早已归属李世民。尉迟恭哪里是来护驾，分明是逼宫。
识时务者为俊杰，李渊就一贯识时务。他马上按照尉迟恭的要求手书敕令，天策府司马宇文士及从东上阁门出来宣布敕令，众人便这样安定下来了。又让黄门侍郎裴寂前往东宫开导原李建成麾下的诸将士，将士们便都弃职而散。
直到这时，李世民才应召入宫。
父子相见恍如隔世。秦王扑到皇帝怀中，亲吻着父亲的**泣不成声，李渊也老泪纵横抚摸着孝顺的好儿子，双方都心领神会的交易则在抱头痛哭时暗中达成：做皇帝的父亲将交出最高权力，接班的儿子则保证他安享晚年。
史载：建成子安陆王承道、河东王承德、武安王承训、汝南王承明、钜鹿王承义，元吉子梁郡王承业、渔阳王承鸾、普安王承奖、江夏王承裕、义阳王承度，皆坐诛，仍绝属籍。
那一日，天策军在尉迟恭的带队下，把东宫围了起来。太子妃冷眼怒视尉迟恭：“可有三尺白绫？短匕？毒酒？”
“太上皇召太子妃入宫，臣等特来邀之。”
“容我梳理衣装。”太子妃回到内院。
此刻王珪、魏征皆甲胄在身：“容臣等护佑主母离开。”
“王公！魏公！大势所趋，成王败寇。二位乃是宰相之才，怎么可以轻轻了却性命。人固有一死，死有重于泰山，或轻于鸿毛。夫君在世时，常与妾身言：天下黎民乃是天下之本。二位乃是宰相之才，当以胸怀天下，而不是为一妇人舍命。前汉太史公迁，忍宫刑之辱而留下史家绝唱。王公！魏公！当为天下计啊！活着才是对夫君最大的效忠。”太子妃已是泪眼轻语凝噎。